Enzeptional (GT4SD) para otimização de enzimas
Guia para utilizar a abordagem de algoritmo genético assistido por substituto no Enzeptional (GT4SD), permitindo otimização de enzimas com suporte a simulações aceleradas por GPU.
Abrir tutorial ↗Tutoriais
Guias práticos para otimização de enzimas e simulações moleculares com aceleração por GPU.
Dinâmica Molecular com AMBER
Tutorial aplicado a frutano de inulina, levana e sacarose, incluindo cálculo de ângulos diedros para restrição de ligante nas etapas de minimização e equilíbrio, além de execução com aceleração por GPU.
Abrir tutorial ↗Dinâmica Molecular com GROMACS + GMX_MMPBSA
Passo a passo para simulações de dinâmica molecular no GROMACS com cálculo de energia livre de ligação utilizando GMX_MMPBSA.
Abrir tutorial ↗QM/MM com AMBER + QUICK
Fluxo completo de dinâmica molecular híbrida, detalhando diferenças entre execução via FBI (File-Based Interface) e API (Application Programming Interface), com análise de desempenho.
Abrir tutorial ↗